2) Дублируем дублированный слой. Применяем фильто-размытие-радиальное размытие. Примерные настройки:

Режим смешивания меняем на умножение.

3) Создаём новый слой. Применяем фильтр-рендеринг-облака. Переходим в фильтр-рендеринг-облака с наложением. Нажимаем Ctrl+F несколько раз, пока не понравится результат.
Примерно такой:

4) Применем уровни Ctrl+L.
Примерные настройки:

И, изменим режим на осветление основы.

5)
Как видим небо "заехало" на воду. Исправим это. Создадим выделение с помощью инструмента прямоугольная область, и с помощью деформации Ctrl+T просто "поднимем" небо над водой.

6) Уберём слишком яркие области. Перейдём на каналы.

Зажав Ctrl кликаем по каналу красный, что бы создать выделение. Инвертируем выделение (выделение-инверсия). Растушевываем его на 10 рх (Ctrl+Alt+D), и не снимая выделения возвращаемся на палитру слоёв. Под палитрой нажимаем на слой-маску. Выбираем слой маску и регулируем яркость с помощью уровней.

7) Если изображение слишком тёмное/светлое, можно слегка отрегулировать цветовой баланс (Ctrl+B).
Вот, что мы имеем на данном этапе:

8) Создаём новый слой. С помощью инструмента прямоугольное выделение создаём прямоугольник. Берём чёрно-белый градиент и проводим слева направо внутри прямоугольника.

9) Не снимая выделения переходим в фильтр-рендеринг-облака с наложением.

10) Нажимаем Ctrl+I. Регулируем уровни и меняем режим смешивания на осветление. Используя мягкий ластик стираем видимые границы.

При желании добавим ещё молний.
Получаем вот такую картинку:

А вот так картинка выглядела до фш: